Proč pátá a největší vlna japonské pandemie koronaviru, poháněná supernakažlivou variantou „Delta“, náhle skončila po zdánlivě neúprosném nárůstu nových infekcí? A čím se Japonsko liší od ostatních rozvinutých zemí, které nyní zaznamenávají nový nárůst případů?
Podle skupiny japonských vědců může být překvapivou odpovědí, že varianta Delta se o sebe postarala aktu „sebezmizení“.
Tři měsíce poté, co varianta Delta vyvolala celostátní rekordní denní počet případů téměř 26 000, počet nových japonských infekcí COVID-19 prudce klesl a v posledních týdnech klesl pod 200. Například 7. listopadu nebyla hlášena žádná úmrtí – poprvé po asi 15 měsících.
Mnoho vědců poukazuje na různé možnosti, mezi které patří jedna z nejvyšších proočkovaností v Japonsku mezi rozvinutými zeměmi u 75,7 % obyvatel. Dalšími potenciálními faktory jsou sociální distancování a opatření na nošení masek, která jsou nyní hluboce zakořeněna v japonské společnosti.
Hlavní důvod ale může souviset s genetickými změnami, kterými koronavirus prochází během své reprodukce, a to rychlostí asi dvou mutací za měsíc. Podle potenciálně převratné teorie navržené Ituro Inouem, profesorem z Národního institutu genetiky, varianta Delta v Japonsku nashromáždila příliš mnoho mutací nestrukturálního proteinu viru nazvaného nsp14, který opravuje chyby. V důsledku toho se virus snaží opravit chyby včas, což nakonec vedlo k jeho "sebezničení".
Studie ukazují, že většina lidí v Asii má ve srovnání s lidmi v Evropě a Africe ochranný enzym zvaný APOBEC3A, který napadá RNA viry, včetně viru SARS-CoV-2, který způsobuje COVID-19. Vědci z National Institute of Genetics a Niigata University se proto rozhodli zjistit, jak protein APOBEC3A ovlivňuje protein nsp14 a zda může inhibovat aktivitu koronaviru
Tým analyzoval údaje o genetické rozmanitosti variant „Alfa“a „Delta“u infikovaných pacientů v Japonsku od června do října.
Poté vizualizovali vztahy mezi sekvencemi DNA viru SARS-CoV-2, aby ukázali genetickou rozmanitost v diagramu zvaném haplotypová síť. Obecně platí, že čím větší síť, tím více pozitivních případů představuje.
Síť varianty „Alpha“, která byla hlavním motorem čtvrté vlny v Japonsku od března do června, má pět velkých skupin s mnoha větvenými mutacemi, což potvrzuje vysokou úroveň genetické diverzity. Vědci se domnívají, že varianta „Delta“, která je podle amerického Centra pro kontrolu a prevenci nemocí více než dvakrát nakažlivější než předchozí varianty a může způsobit závažnější onemocnění u neočkovaných lidí, bude mít mnohem větší živou genetickou rozmanitost.
Je to překvapivé, ale japonští vědci objevili fakta dokazující opak. Haplotypová síť má pouze dvě hlavní skupiny a zdá se, že mutace se náhle zastaví uprostřed jejich evolučního vývojového procesu. Když vědci pokračovali ve studiu enzymu nsp14 korigujícího chyby viru, zjistili, že velká většina vzorků nsp14 v Japonsku zřejmě prošla mnoha genetickými změnami v místech mutací, nazývaných A394V.
„Byli jsme doslova šokováni, když jsme viděli výsledky,“řekl Prof. Inoue pro The Japan Times. - Varianta "Delta" v Japonsku byla vysoce infikovaná a neumožňovala jiné varianty. Ale jak se mutace hromadily, myslíme si, že se nakonec stal vadným virem a nedokázal vytvořit své kopie. Vzhledem k tomu, že případů nepřibývá, věříme, že v určitém okamžiku takových mutací zamířil přímo ke svému přirozenému vyhynutí.“
Teorie profesora Inoue, i když je inovativní, podporuje záhadné zmizení Delta Variant rozšířené v Japonsku. Zatímco velká část zbytku světa s podobně vysokou proočkovaností, včetně Jižní Koreje a některých západních zemí, trpí rekordními vlnami nových infekcí, Japonsko se zdá být zvláštním případem, protože případy COVID-19 zůstaly utlumené navzdory vlaky a restaurace se plní po skončení posledního nouzového stavu.
„Kdyby byl virus naživu, případů by jistě přibývalo, protože nošení roušek a očkování v některých případech nezabrání náhlému propuknutí infekcí,“poznamenal prof. Inoue.
Skutečně neočekávaný pokles nových případů po letní vlně je podle Takeshiho Urana, profesora na Shimane University School of Medicine, žhavým tématem diskuse mezi mnoha odborníky, včetně těch, kteří neprovádějí výzkum koronaviru. který se neúčastnil výzkumu vedeného prof. Inoue.
„Nsp14 spolupracuje s jinými virovými proteiny a má kritickou funkci při ochraně virové RNA před degradací,“říká na otázku o Prof. Inoue. -Studie ukazují, že virus se zmrzačeným nsp14 má výrazně sníženou schopnost replikace, takže to může být jeden z faktorů rychlého poklesu nových případů.“
Dobrou zprávou je, že Nsp14 byl nyní úspěšně extrahován z viru a chemické činidlo omezující tento protein se může stát slibným lékem, přičemž vývoj probíhá.
Japonsko se zdá být anomálií, protože varianta Delta účinně brání šíření Alfa a dalších variant covidu až do konce srpna. Na druhou stranu zbytek zemí – včetně Indie a Indonésie, které byly variantou Delta obzvláště těžce zasaženy – hlásily mezi případy kombinaci kmenů Alpha a Delta.
„Podobné přirozené vymizení koronaviru bylo možné pozorovat v zahraničí,“řekl profesor Inoue a dodal, že by to bylo obtížné odhalit, protože se zdá, že žádná jiná země nenashromáždila tolik mutací v nsp14 viru, jako v roce Japonsko, ačkoli podobné mutace v místě A394V byly nalezeny v nejméně 24 zemích.
Teorie profesora Inoueho může také pomoci vysvětlit, proč vypuknutí těžkého akutního respiračního syndromu (SARS) v roce 2003 náhle skončilo. nakonec se nemůže reprodukovat, protože se v něm hromadí mutace.
„Žádná data o genomu neexistují, takže je to jen hypotéza, ale protože je pryč, už nikdy nespatří světlo světa,“říká prof. Inoue.
Jaká je tedy šance, že v zahraničí dojde k podobnému přirozenému vyhynutí viru SARS-CoV-2, který způsobuje COVID-19?
„Šance nejsou nulové, ale zatím se to zdá příliš optimistické, protože takové důkazy nemůžeme získat, ačkoli jsme se dívali na různá data i z jiných zemí. Po svém maximu v polovině srpna denní počet případů COVID-19 v Japonsku nadále klesal, až do poloviny září klesl pod 5 000 a do konce října pod 200.
Po nějakou dobu se země těší jedné z nejnižších infikovaných zemí ze všech vyspělých zemí, ale není imunní vůči další vlně pandemie, říká prof. Inoue. - Očividně existuje hrozba. Byli jsme v pořádku, protože Delta v Japonsku zadržela ostatní varianty koronaviru mimo zemi. Ale teď, když je nic nedrží na uzdě, byl vytvořen prostor pro nové a samotné vakcíny problém nevyřeší. V tomto smyslu si myslím, že karanténní opatření ke kontrole přistěhovalectví jsou velmi důležitá, protože nikdy nevíme, co k nám může přijít z jiných zemí."
Někteří vědci spekulovali, že samovyhynutí varianty Delta v Japonsku je způsobeno něčím zvláštním v genech Japonců, ale prof. Inoue nesouhlasí.
„To si nemyslím – profesor Inoue je důrazný. - Lidé ve východní Asii, stejně jako Korejci, jsou etnicky stejní jako Japonci. Ale nevím, proč bylo toto pozorování učiněno pouze v Japonsku.“
Prof. Inoue také říká, že tým výzkumníků z National Institute of Genetics a Niigata University plánuje provést důkladnou studii svých zjištění do konce listopadu.
